| 日本長編部門 | グッドラック 戦闘妖精・雪風 | 神林長平 |
| 日本短編部門 | 太陽の簒奪者 | 野尻抱介 |
| 海外長編部門 | キリンヤガ | マイク・レズニック |
| 海外短編部門 | 星々の荒野から | ジェイムズ・ティプトリー・ジュニア |
| メディア部門 | カウボーイ・ビバップ | 渡辺信一郎 |
| コミック部門 | イティハーサ | 水樹和佳子 |
| アート部門 | 鶴田謙二 | |
| ノンフィクション部門 | エンタテインメントロボット“ＡＩＢＯ” | ソニー |
| 日本長編部門 | |||
| 作品名 | 作者 | 初出 | 備考 |
| ペリペティアの福音 | 秋山完 | 朝日ソノラマ文庫 | |
| 西の善き魔女 | 荻原規子 | 中央公論社Ｃ☆ノベルズ | ※１ |
| グッドラック 戦闘妖精・雪風 | 神林長平 | 早川書房 | ※２ |
| ドラゴンファームのこどもたち | 久美沙織 | プランニングハウス ファンタジーの森 | ※３ |
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※１：シリーズ最終巻第五巻 (ISBN4-12-500591-5)は1999年5月25日に発売になっている。 ※２：単行本は1999年5月15日発売(ISBN4-15-208223-2)。 ※３：（下巻）は1999年12月26日発売 (ISBN4-939073-28-9)。同作品は「ドラゴンファームシリーズ」の最終巻でもある。 | |||
| 海外長編部門 | |||
| 作品名 | 作者 | 初出 | 備考 |
| キリンヤガ | マイク・レズニック | 早川書房 1999年5月20日 | ※１ |
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※１：単行本収録の「空に触れた少女」及び「ブワナ」はＳＦマガジン収録年の海外短編部門候補として挙がっているが、シリーズ全体でのノミネートはない為、受賞資格を持つ。 | |||
| 日本短編部門 | |||
| 作品名 | 作者 | 初出 | 備考 |
| 繁殖 | 谷甲州 | 『宇宙への帰還』収録 KSS出版1999年4月30日初版発行 | |
| 太陽の簒奪者 | 野尻抱介 | ＳＦマガジン９月増刊号 | ※１ |
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※１：作者によれば、三部連作の構想の一作目。二作目の「蒼白の黒体輻射」がSFM2月号に掲載。 | |||
| メディア部門 | |||
| 作品名 | 作者 | 初出 | 備考 |
| カウボーイ・ビバップ | 監督：渡辺信一郎 サンライズ | 〜1999年4月23日(WOWOW) | ※１ |
| 劇場版デジモンアドベンチャー | 監督：細田守 東映動画 | 1999年三月上映 | |
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※１：最初の放送はテレビ東京にて1998年6 月26日までだったが、これは全26話中12話しか放送されなかった。完全な 形で終了したのは1998〜1999年のWOWOWでの放送になる。 | |||
| コミック部門 | |||
| 作品名 | 作者 | 初出 | 備考 |
| なつのロケット | あさりよしとお | 白泉社ヤングアニマル 1999 No.16〜No.20 | |
| ワッハマン | あさりよしとお | 講談社 アフタヌーン 〜99年4月号 | |
| スタンダードブルー | 宇河弘樹 | 少年画報社 | ※１ |
| だいらんど | があさん | 大都社 1999年9月 | ※２ |
| プラネテス PHASE.2 地球外少女 | 幸村誠 | モーニング 1999年28号 p.259-304 | ※３ |
| 空からこぼれた物語(ストーリー) | 大石まさる | 少年画報社 1999年9月27日 | ※４ |
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※１：単行本は1999年5月15日発売。 ※２：連載は少年画報社YK OURs1998年8月号〜1999年9月号。 ※３：宇宙開拓黎明期の近未来を舞台にした連作シリーズ。 ※４：ＳＦと日常の入り混じった雰囲気の作品を含んだ短編集。 ISBN4-7859-1942-6 | |||
| アート部門 | |||
| アーティスト名 | 代表作 | 代表作初出 | 備考 |
| 勝連 | 平井和正「決定版幻魔大戦」表紙・挿絵 | 集英社文庫1999年7月〜12月 | |
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